Eugene é onde o vírus foi estudada em primeiro lugar, depois de detectar o vírus Cascade no seu computador, em Outubro de 1989.
Eugene analisa o vírus desenvolve e módulos para a primeira vez que o vírus de desinfecção. Desde então, ele começou a coletar programas maliciosos e módulos para a desinfecção desses vírus. A coleção mais tarde tornou-se a fundação do banco de dados de antivírus conhecido como Kaspersky Antivirus. Atualmente, o banco de dados tem 1,3 milhões de registros e é uma das bases de dados antivírus mais completas do mundo.
Em 1991, Eugene juntou os EUA Tecnologias de Informação Center, onde Eugene e seus colegas desenvolveram um grupo de projeto de antivírus AVP, que se tornou a forma básica da Kaspersky Antivirus. Reconhecimento mundial para o projeto em 1994, onde AVP não é conhecido por ter vencido um concurso organizado pela Universidade de Hamburgo de testes de laboratório, mostrando que a taxa de detecção de vírus é maior do que os programas antivírus mais populares na época. Então, em 1997, Eugene e co-parceiro decidiu criar uma empresa independente, que mais tarde tornou-se o fundador da Kaspersky Lab.
Desde então, Eugene dirige a empresa de pesquisa de anti-vírus. Até que, finalmente, em 2007, está posicionado como o CEO Eugene Kaspersky Lab.