Se a estabilidade local e tempo de atividade são fundamentais para você e seu novo site, em seguida, Unix deve ser sua escolha, porque eles são geralmente pensado para ser superior em estabilidade. Janelas têm a desvantagem de que eles normalmente requerem a reinicialização muito mais frequentemente. Ainda Windows são milhas à frente quando se trata de facilidade de uso. Um sistema operacional de servidor Windows será geralmente muito mais fácil de operar e administrar do que o seu homólogo Unix.
Por outro lado, Unix, mesmo com a sua estabilidade não pode acabar sendo tão fácil de usar, especialmente para os não-técnicos. Há também um preço a pagar para a estabilidade extra que é evidente em sistemas Unix. Normalmente máquinas Unix vai exigir o seu software a ser atualizado em uma base muito regular. Ao todo, sistemas operacionais de servidor Unix são favorecidos em detrimento de janelas como eles são amplamente considerado mais estável.
Ainda assim, se a verdade seja dita, quando ambos os sistemas são instalados corretamente, não há realmente muito pouca diferença e eles vão te dar basicamente os mesmos resultados. Com efeito, isso não torna esta uma decisão fácil de alcançar. Na verdade, este é o principal fator que complica a questão, causando ainda mais confusão e tornando-se muito difícil para o webmaster para tomar uma decisão ou outra maneira.
No entanto, para muitos, a resposta definitiva para a questão de qual sistema operacional do servidor é preferível, é muitas vezes feita por analisar e comparar os custos de ambos e indo com a opção mais acessível.