Abaixo da Biblioteca, SPARTAN-117 encontra-se nas garras do Gravemind, a criatura que atua como o inteligência sensível do Dilúvio. Apesar de Thel "Vadamee caiu de uma grande altura, ele é salvo de mergulhar a sua morte por tentáculos do Gravemind. É dentro da câmara do Gravemind onde Thel 'Vadamee e SPARTAN-117 se encontram. Além disso, o Profeta of Regret está infectado e assimilado sua massa. Também foi introduzida é 2401 Penitente é tangente, Monitor de Instalação 05.
Ambos os personagens agem como exposição à Thel 'Vadamee, como Regret continua firme em sua fé, eo Monitor está plenamente consciente de seu status como uma arma. Thel 'Vadamee é ainda levou a questionar sua fé por ambos os SPARTAN-117 eo próprio Gravemind, como ambos tentam convencer o Elite que a crença do Pacto Internacional sobre o Halos é uma mentira, revelando que o Halos destruir a vida, não salvá-lo . Estas informações, bem como a informação do genocídio iminente das Elites levar Thel 'Vadamee relutantemente juntar SPARTAN-117 na missão de parar o anel que está sendo ativado.
O Gravemind envia tanto o SPARTAN-117 e Thel 'Vadamee para diferentes locais para ajudar a parar o Índice de atingir o seu destino. SPARTAN-117 foi enviado a High Charity para recuperar o índice enquanto Thel 'Vadamee foi enviado para a área onde a sala de controle de instalação 05 a suspender o Pacto de ativar os anéis.
SPARTAN-117, em seguida, entra no meio de uma conferência da Verdade. O Profeta da Verdade, depois de escapar de assassinato, foge para o Dreadought. John-117 persegue-o, matando muitas tropas da Aliança no caminho.
Ele também testemunhas do conflito entre as elites e Brutes. SPARTAN-117 salva alguns fuzileiros navais ao longo do caminho. Enquanto isso, o Dilúvio, sob o controle do acidente Gravemind em alta Caridade usando o Clad em âmbar. Quando John quase atende Verdade, ele encontra Mercy ser infec